Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHA9Q7RTU4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHLHA9Q7RTU4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHA9Q7RTU4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms