Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
XIRP1Q702N8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
XIRP1Q702N8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
XIRP1Q702N8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
XIRP1Q702N8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
XIRP1Q702N8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
XIRP1Q702N8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
XIRP1Q702N8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
XIRP1Q702N8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
XIRP1Q702N8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
XIRP1Q702N8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
XIRP1Q702N8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms