Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C9orf139Q6ZV77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C9orf139Q6ZV77 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf139Q6ZV77 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf139Q6ZV77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf139Q6ZV77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf139Q6ZV77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf139Q6ZV77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf139Q6ZV77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf139Q6ZV77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf139Q6ZV77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms