Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY4Q6ZNE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUFY4Q6ZNE9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RUFY4Q6ZNE9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUFY4Q6ZNE9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms