Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DCLRE1AQ6PJP8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DCLRE1AQ6PJP8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCLRE1AQ6PJP8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms