Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK3Q6PHR2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK3Q6PHR2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ULK3Q6PHR2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ULK3Q6PHR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms