Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF549Q6P9A3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF549Q6P9A3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF549Q6P9A3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms