Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN3Q6P5Z2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKN3Q6P5Z2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKN3Q6P5Z2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms