Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C22orf39Q6P5X5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C22orf39Q6P5X5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C22orf39Q6P5X5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C22orf39Q6P5X5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms