Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 22.57□□□□□ -24e-22■■■■■ 59.6
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PRPF8Q6P2Q9 SMC1A-203ENST00000428014 868 ntTSL 37.88□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 59.6
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PRPF8Q6P2Q9 LUC7L3-207ENST00000505619 658 ntTSL 312.07□□□□□ -0.484e-9■■■■■ 59.5
PRPF8Q6P2Q9 LUC7L3-213ENST00000508218 533 ntTSL 29.95□□□□□ -0.824e-9■■■■■ 59.5
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PRPF8Q6P2Q9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.476e-31■■■■■ 59.4
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PRPF8Q6P2Q9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.586e-16■■■■■ 59.4
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PRPF8Q6P2Q9 AP1S3-201ENST00000334271 2201 ntTSL 28.15□□□□□ -1.116e-16■■■■■ 59.4
PRPF8Q6P2Q9 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.196e-16■■■■■ 59.4
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PRPF8Q6P2Q9 CCNT2-208ENST00000452839 2363 ntTSL 29.4□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 58.9
PRPF8Q6P2Q9 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 58.9
PRPF8Q6P2Q9 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.754e-7■■■■■ 58.9
PRPF8Q6P2Q9 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.479e-9■■■■■ 58.9
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PRPF8Q6P2Q9 N4BP2-202ENST00000511480 9747 ntTSL 1 (best)3.06□□□□□ -1.929e-9■■■■■ 58.9
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PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-223ENST00000545396 1341 ntTSL 515.73■□□□□ 0.117e-10■■■■■ 58.8
PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-10■■■■■ 58.8
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PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.047e-10■■■■■ 58.8
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PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-10■■■■■ 58.8
PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.087e-10■■■■■ 58.8
PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.17e-10■■■■■ 58.8
PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-221ENST00000545056 1568 ntTSL 513.74□□□□□ -0.217e-10■■■■■ 58.8
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PRPF8Q6P2Q9 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.547e-10■■■■■ 58.8
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