Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LLGL2Q6P1M3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LLGL2Q6P1M3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LLGL2Q6P1M3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LLGL2Q6P1M3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms