Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RGMBQ6NW40 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGMBQ6NW40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RGMBQ6NW40 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RGMBQ6NW40 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms