Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CENPPQ6IPU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPPQ6IPU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPPQ6IPU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPPQ6IPU0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPPQ6IPU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms