Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICL7

SLC35E4, Solute carrier family 35 member E4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E4Q6ICL7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC35E4Q6ICL7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC35E4Q6ICL7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC35E4Q6ICL7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms