Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN12

MCTP2, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP2Q6DN12 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MCTP2Q6DN12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCTP2Q6DN12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCTP2Q6DN12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCTP2Q6DN12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MCTP2Q6DN12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MCTP2Q6DN12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCTP2Q6DN12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCTP2Q6DN12 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP2Q6DN12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms