Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
YOD1Q5VVQ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YOD1Q5VVQ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YOD1Q5VVQ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YOD1Q5VVQ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms