Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CACHD1Q5VU97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACHD1Q5VU97 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACHD1Q5VU97 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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