Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYOM3Q5VTT5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
MYOM3Q5VTT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
MYOM3Q5VTT5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
MYOM3Q5VTT5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MYOM3Q5VTT5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
MYOM3Q5VTT5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
MYOM3Q5VTT5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
MYOM3Q5VTT5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MYOM3Q5VTT5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms