Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGAP40Q5TG30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGAP40Q5TG30 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP40Q5TG30 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms