Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYCP2LQ5T4T6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYCP2LQ5T4T6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms