Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1J5

CHCHD2P9, Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHCHD2P9Q5T1J5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHCHD2P9Q5T1J5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHCHD2P9Q5T1J5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms