Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf141Q5SZD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C6orf141Q5SZD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6orf141Q5SZD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms