Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HERC4Q5GLZ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HERC4Q5GLZ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC4Q5GLZ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms