Protein–RNA interactions for Protein: Q53ET0

CRTC2, CREB-regulated transcription coactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC2Q53ET0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTC2Q53ET0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRTC2Q53ET0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRTC2Q53ET0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms