Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAL1Q4LDG9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAL1Q4LDG9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAL1Q4LDG9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms