Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FBXO43Q4G163 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO43Q4G163 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO43Q4G163 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO43Q4G163 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms