Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNF212Q495C1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RNF212Q495C1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms