Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNPY1Q3B7I2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNPY1Q3B7I2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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