Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPPQ16740 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPPQ16740 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPPQ16740 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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