Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MRPL23Q16540 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MRPL23Q16540 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MRPL23Q16540 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL23Q16540 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL23Q16540 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL23Q16540 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRPL23Q16540 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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