Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDSNQ15517 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDSNQ15517 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDSNQ15517 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDSNQ15517 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDSNQ15517 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDSNQ15517 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDSNQ15517 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDSNQ15517 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDSNQ15517 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDSNQ15517 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDSNQ15517 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDSNQ15517 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDSNQ15517 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDSNQ15517 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDSNQ15517 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDSNQ15517 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDSNQ15517 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDSNQ15517 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDSNQ15517 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDSNQ15517 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDSNQ15517 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDSNQ15517 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDSNQ15517 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDSNQ15517 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDSNQ15517 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDSNQ15517 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDSNQ15517 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDSNQ15517 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDSNQ15517 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDSNQ15517 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDSNQ15517 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDSNQ15517 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDSNQ15517 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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