Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTF1Q15361 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TTF1Q15361 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTF1Q15361 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTF1Q15361 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
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