Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC41Q15345 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC41Q15345 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC41Q15345 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms