Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCF4Q15080 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCF4Q15080 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCF4Q15080 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCF4Q15080 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCF4Q15080 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCF4Q15080 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCF4Q15080 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCF4Q15080 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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