Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
EEA1Q15075 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
EEA1Q15075 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
EEA1Q15075 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
EEA1Q15075 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC40.06■■■■■ 4
EEA1Q15075 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
EEA1Q15075 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
EEA1Q15075 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
EEA1Q15075 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.04■■■■■ 4
EEA1Q15075 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
EEA1Q15075 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.03■■■■■ 4
EEA1Q15075 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
EEA1Q15075 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC40.03■■■■■ 4
EEA1Q15075 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
EEA1Q15075 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.02■■■■■ 4
EEA1Q15075 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
EEA1Q15075 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
EEA1Q15075 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
EEA1Q15075 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
EEA1Q15075 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
EEA1Q15075 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
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