Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF6Q15052 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF6Q15052 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF6Q15052 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF6Q15052 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF6Q15052 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF6Q15052 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF6Q15052 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF6Q15052 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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ARHGEF6Q15052 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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ARHGEF6Q15052 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF6Q15052 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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ARHGEF6Q15052 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
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ARHGEF6Q15052 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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ARHGEF6Q15052 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
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ARHGEF6Q15052 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARHGEF6Q15052 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF6Q15052 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
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