Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL9A2Q14055 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL9A2Q14055 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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