Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNC3Q14003 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNC3Q14003 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms