Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RASGRF1Q13972 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RASGRF1Q13972 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RASGRF1Q13972 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RASGRF1Q13972 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RASGRF1Q13972 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RASGRF1Q13972 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
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