Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA9Q13797 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA9Q13797 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA9Q13797 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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