Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMQ13315 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMQ13315 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMQ13315 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMQ13315 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMQ13315 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMQ13315 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATMQ13315 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATMQ13315 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATMQ13315 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATMQ13315 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMQ13315 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMQ13315 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMQ13315 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMQ13315 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMQ13315 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMQ13315 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMQ13315 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMQ13315 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMQ13315 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMQ13315 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMQ13315 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMQ13315 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMQ13315 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMQ13315 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMQ13315 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMQ13315 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATMQ13315 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMQ13315 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMQ13315 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMQ13315 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMQ13315 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMQ13315 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATMQ13315 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMQ13315 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMQ13315 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMQ13315 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMQ13315 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMQ13315 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMQ13315 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATMQ13315 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMQ13315 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMQ13315 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMQ13315 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMQ13315 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMQ13315 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMQ13315 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMQ13315 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATMQ13315 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATMQ13315 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATMQ13315 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMQ13315 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMQ13315 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMQ13315 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMQ13315 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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