Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN3Q13286 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN3Q13286 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN3Q13286 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLN3Q13286 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLN3Q13286 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLN3Q13286 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLN3Q13286 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLN3Q13286 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLN3Q13286 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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