Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF1Q13077 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF1Q13077 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
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TRAF1Q13077 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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TRAF1Q13077 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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TRAF1Q13077 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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TRAF1Q13077 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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TRAF1Q13077 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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TRAF1Q13077 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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TRAF1Q13077 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF1Q13077 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF1Q13077 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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