Protein–RNA interactions for Protein: Q13065

GAGE1, G antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE1Q13065 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GAGE1Q13065 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GAGE1Q13065 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GAGE1Q13065 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms