Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFX1Q12986 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFX1Q12986 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NFX1Q12986 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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