Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN1Q12860 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN1Q12860 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN1Q12860 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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