Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FMODQ06828 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FMODQ06828 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FMODQ06828 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FMODQ06828 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FMODQ06828 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FMODQ06828 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FMODQ06828 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FMODQ06828 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FMODQ06828 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FMODQ06828 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FMODQ06828 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FMODQ06828 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FMODQ06828 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FMODQ06828 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FMODQ06828 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FMODQ06828 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FMODQ06828 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FMODQ06828 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FMODQ06828 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FMODQ06828 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FMODQ06828 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FMODQ06828 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FMODQ06828 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FMODQ06828 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FMODQ06828 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FMODQ06828 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FMODQ06828 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FMODQ06828 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FMODQ06828 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FMODQ06828 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FMODQ06828 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FMODQ06828 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FMODQ06828 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FMODQ06828 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FMODQ06828 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FMODQ06828 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FMODQ06828 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FMODQ06828 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FMODQ06828 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FMODQ06828 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FMODQ06828 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FMODQ06828 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FMODQ06828 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FMODQ06828 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FMODQ06828 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FMODQ06828 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FMODQ06828 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FMODQ06828 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FMODQ06828 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FMODQ06828 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FMODQ06828 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FMODQ06828 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FMODQ06828 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FMODQ06828 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FMODQ06828 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FMODQ06828 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FMODQ06828 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FMODQ06828 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FMODQ06828 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FMODQ06828 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FMODQ06828 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FMODQ06828 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FMODQ06828 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FMODQ06828 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FMODQ06828 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FMODQ06828 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FMODQ06828 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FMODQ06828 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FMODQ06828 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FMODQ06828 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms