Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTK2Q05397 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTK2Q05397 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTK2Q05397 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms