Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ATP7AQ04656 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
ATP7AQ04656 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP7AQ04656 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP7AQ04656 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP7AQ04656 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms