Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIBQ01892 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPIBQ01892 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPIBQ01892 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms